Tutte le directory devono avere permessi 755 (lettura, scrittura ed esecuzione solo per il proprietario, per gli altri solo lettura ed esecuzione). I file html (o comunque non cgi) devono avere permessi 644 o 666 o 755, mentre i cgi devono avere obbligatoriamente 755 (per l'esecuzione). Per i file php su cui è necessario scrivere, per i quali i permessi vanno settati a chmod 777.